Больница №2 ПОМЦ Нижнего Новгорода, являясь структурным подразделением многопрофильного центра, использует все его лечебно-диагностические возможности. Больница предоставляет медицинские услуги в рамках ОМС, ДМС и платно.
В составе 2-й больницы медицинского центра ФМБА функционирует несколько отделений: приемно-консультативное, анестезиологии и реанимации, неврологическое, нейрохирургическое, физиотерапевтическое, лучевой диагностики, а также реабилитационный центр.