Клиника Центра Молекулярной Диагностики работает с апреля 2007 года и осуществляет различные виды медицинской помощи: первичную, в том числе доврачебную, врачебную и специализированную, медико-санитарную помощь. Пациентам, как взрослым, так и детям, оказываются медицинские услуги более чем по 30 направлениям. Ежегодно обслуживается свыше 60000 пациентов. Клиника ЦМД оснащена современным медицинским оборудованием, в том числе эндоскопическим. Имеет два операционных блока и стационар дневного пребывания.

В Клинике работают более двухсот специалистов- педиатры, терапевты, акушеры-гинекологи, аллергологи, кардиологи, врачи функциональной и ультразвуковой диагностики, эндокринологи, нефрологи, эндоскописты, хирурги, ортопеды, офтальмологи, оториноларингологи, урологи, неврологи, колопроктологи, нейрохирурги, физиотерапевты, эпидемиолог по вопросам иммунопрофилактики. Среди них кандидаты медицинских наук, докторы медицинских наук, заслуженные врачи РФ.

Специалистами Клиники разработаны специальные программы: детские, корпоративные, индивидуальные программы ведения беременности. Особой популярностью пользуется программа «Педиатрический абонемент»— индивидуальное обслуживание ребенка педиатром с выездом на дом. С 2015 года подобная программа разработана для взрослого населения с выездом врача терапевта на дом.

Ежегодно список услуг Клиники расширяется. Приобретается новое современное оборудование. Например, аппарат факоэмульсификатор, который позволяет делать сложные офтальмологические операции. Так после удаления катаракты пациент через несколько часов самостоятельно уходит домой. Приобретение риноскопа дало возможность более точно исследовать слизистую носоглотки и назначать адекватное лечение, часто избавляя пациента от ненужных операций.

В 2016 году был приобретен цифровой микродозный маммограф Philips. Маммография позволяет выявить опухоли, уплотнения или другие изменения в области грудных желез, а также рак молочной железы на начальной стадии.

Сотрудники Клиники принимают участие в научных и практических конференциях. Регулярно проходят дополнительное обучение, в том числе и за рубежом в клиниках Германии, Израиля, Франции.

В 2009 и 2012 годах Клиника ЦМД была признана лучшей в Сибири по итогам межрегионального конкурса лучших товаров и услуг «Гемма».